Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRPF1P55201 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms