Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AFDNP55196 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AFDNP55196 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AFDNP55196 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms