Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF2A1P52655 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms