Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POU3F4P49335 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POU3F4P49335 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms