Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDO2P48775 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDO2P48775 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDO2P48775 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms