Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOX2P48431 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOX2P48431 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOX2P48431 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOX2P48431 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms