Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABRA2P47869 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABRA2P47869 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms