Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
XCR1P46094 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
XCR1P46094 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
XCR1P46094 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
XCR1P46094 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms