Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNT2P45379 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNT2P45379 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms