Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL35P42766 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL35P42766 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL35P42766 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPL35P42766 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms