Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP7BP35670 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms