Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms