Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASQ1P31415 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASQ1P31415 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms