Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXC12P31275 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms