Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXA11P31270 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA11P31270 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms