Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID4AP29374 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID4AP29374 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms