Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2E2P29084 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms