Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD34P28906 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD34P28906 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD34P28906 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms