Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HTR2AP28223 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms