Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRKACBP22694 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms