Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RAB5AP20339 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB5AP20339 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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