Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGB6P18564 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGB6P18564 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms