Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTPS1P17812 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTPS1P17812 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTPS1P17812 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTPS1P17812 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTPS1P17812 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTPS1P17812 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms