Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNT1P13805 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNT1P13805 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNT1P13805 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNT1P13805 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNT1P13805 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TNNT1P13805 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms