Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYL1P12980 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYL1P12980 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYL1P12980 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms