Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD8BP10966 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD8BP10966 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD8BP10966 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD8BP10966 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms