Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HKR1P10072 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HKR1P10072 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms