Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PGA3P0DJD8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms