Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CT47B1P0C2W7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms