Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXB5P09067 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms