Protein–RNA interactions for Protein: P02753

RBP4, Retinol-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP4P02753 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP4P02753 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP4P02753 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP4P02753 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RBP4P02753 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms