Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDE8BO95263 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE8BO95263 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms