Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPFIA4O75335 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms