Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG13O75143 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG13O75143 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms