Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTSVO60911 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTSVO60911 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTSVO60911 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms