Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME2P1O60361 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME2P1O60361 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms