Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SUSD5O60279 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms