Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATP9BO43861 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms