Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRGAP3O43295 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms