Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLDN34H7C241 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms