Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPIPA5E9PKD4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms