Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLDN25C9JDP6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLDN25C9JDP6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms