Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A8MVJ9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A8MVJ9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A8MVJ9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A8MVJ9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
A8MVJ9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A8MVJ9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
A8MVJ9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms