Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NOTOA8MTQ0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms