Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH2D7A6NKC9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms