Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IRGMA1A4Y4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms