Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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