Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N4

TRBV25-1, T-cell receptor beta variable 25-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV25-1A0A075B6N4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV25-1A0A075B6N4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV25-1A0A075B6N4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV25-1A0A075B6N4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TRBV25-1A0A075B6N4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TRBV25-1A0A075B6N4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TRBV25-1A0A075B6N4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV25-1A0A075B6N4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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