Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CHTOPQ9Y3Y2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CHTOPQ9Y3Y2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms