Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDZRN3Q9UPQ7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms